湖南新宁人，1964年5月出生。

中国科学技术大学少年班毕业，无线电电子学工学学士；日本国立综合研究大学院大学（The Graduate

University for Advanced Studies）生物系统科学博士。

1984 - 1999年任中国科学院武汉植物研究所研究实习员、助理研究员、副研究员(1992)、研究员(1996)、副所长(1997)；

1992-1998年曾在University of California-Berkeley和Michigan State University进行合作研究4年；2002－2006年曾两次任日本文部科学省统计数理研究所外国人客员教授；2000年起任复旦大学生命科学学院教授,植物学和生物信息学博士生导师。

现为复旦大学生命科学学院常务副院长，生物多样性与生态工程教育部重点实验室副主任，上海生物信息技术研究中心副主任；兼任北京大学理论生物学中心教授、西藏大学教授等。

中国生物物理学会生物信息学与理论生物物理学专业委员会主任，中国植物学会系统与进化植物学专业委员会副主任。

主要研究方向

分子进化与系统发育，生物信息学

获奖情况

2001年获中国高校自然科学一等奖 (排名第二)

2015年9月17日，由中央电视台和光明日报社联合主办的2015“寻找最美教师”大型公益活动“被推选为活动“特别关注教师”。[1] 

代表性论文和专著

[1] Jung, S., Perkins, S., Zhong, Y., Pramanik, S., Beaman, J. H. 1995. A new data model for biological classification. Computer Applications in Biosciences (CABIOS) 11: 237-246.

[2] Zhong, Y., Jung, S, Pramanik, S, Beaman, J H. 1996. Data model and comparison and query methods for interacting classifications in a taxonomic database. Taxon 45(2): 223-241.

[3] Zhong, Y., Meacham, C. A., Pramanik, S. 1997. A general method for tree-comparison based on subtree similarity and its use in a taxonomic database. BioSystems 42: 1-8.

[4] Zhong, Y., Luo, Y., Pramanik, S., Beaman, J. H. 1999. HICLAS: a taxonomic database system for displaying and comparing biological classification and phylogenetic trees. Bioinformatics 15(2): 149-156.

[5] Zhong, Y., Shi, S. H., Tang, X. H., Huang, Y. L., Tan, F. X., Zhang, X. Y. 2000. Testing relative evolutionary rates and estimating divergence times among six genera of Rhizophoraceae using cpDNA and nrDNA sequences. Chinese Science Bulletin 45: 1011-1015.

[6] Shi, S., Jin, H., Zhong, Y., He, X., Huang, Y., Tan, F., Boufford, D. E. 2000. Phylogenetic relationships of the Magnoliaceae inferred from cpDNA matK sequences. Theoretical and Applied Genetics 101: 925-930.

[7] Sang, T., Zhong, Y. 2000. Testing hybridization hypotheses based on incongruent gene trees. Systematic Biology 49: 422-434.

[8] Cui, X. H., Zhong, Y., Chen, J. K. 2000. Influence of a catastrophic flood on densities and biomasses of three plant species in Poyang Lake, China. Journal of Freshwater Ecology 15: 537-541.

[9] He, Z. C., Zhang, X. Y., Zhong, Y., Ye, L. 2000. Phylogenetic relationships of Actinidia and related genera based on micromorphological characters of foliar trichomes. Genetic Resources and Crop Evolution 47: 627-639.

[10] Wang, J. B., Wang, C., Shi, S. H., Zhong, Y. 2000. ITS regions in diploids of Aegilops (Poaceae) and their phylogenetic implications. Hereditas 132: 209-213.

[11] Wang, J. B., Wang, C., Shi, S. H., Zhong, Y. 2000. Evolution of parental ITS regions of nuclear rDNA in allopolyploid Aegilops (Poaceae) species. Hereditas 133: 1-7.

[12] Zhong, Y., Zhang, L., Su, D. M. 2000. Collaborations tailored for bioinformatics projects. Science 290: 2074. (Letter)

[13] Shi, S., Huang, Y., Zhong, Y., Du, Y., Zhang, Q., Chang, H., Boufford, D.E. 2001. Phylogeny of the Altingiaceae based on cpDNA matK, PY-IGS and nrDNA ITS sequences. Plant Systematics and Evolution 230: 13-24.

[14] Wu, J., Liang, Y., Zhong, Y., Fu, C., Chen, J. 2002. Advances in phylogenetic studies of Nematoda. Chinese Science Bulletin 47: 10-15.

[15] Huang, Y., Shi, S., Zhong, Y., Tan, F. 2002. A new method for preparation of template DNA for PCR from special plant materials. Chinese Science Bulletin 47: 725-727.

[16] Shi, S., Zhong, Y., Huang, Y., Du, Y., Qiu, X., Chang, H. 2002. Phylogenetic relationships of the Rhizophoraceae in China based on sequences of the chloroplast gene matK and the internal transcribed spacer regions of nuclear ribosomal DNA and combined data set. Biochemical Systematics and Ecology 30: 309-319. 等。

主要书籍

【1】 钟扬, 陈家宽, 黄德世, 1990.。数量分类的方法与程序。武汉大学出版社。

【2】 钟扬, 李伟, 黄德世, 1994。分支分类的理论与方法。科学出版社。

【3】 钟扬, 张亮, 赵琼等, 2001。简明生物信息学。高等教育出版社。

【4】 钟扬, 张文娟, 王莉，赵佳媛, 2005。基因计算。上海科技教育出版社。

【5】 李伟, 钟扬编译, 1992。水生植被研究的理论与方法。华中师范大学出版社。

【6】 M. Nei, S. Kumar著, 吕宝忠, 钟扬, 高莉萍等译, 2002。分子进化与系统发育。高等教育出版社。

【7】 D. W. Mount著, 钟扬, 王莉, 张亮等译, 2003。生物信息学。高等教育出版社。

【8】 J. D. Watson著, 钟扬, 沈玮, 赵琼, 王旭译, 2003。基因, 女郎, 伽莫夫。上海科技教育出版社。

【9】 P. Reilly著, 钟扬, 李作峰, 赵佳媛, 赵晓敏译, 2005。林肯的DNA。上海科技教育出版社。